28S-D2
Stems - interleave 1, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2152792.6   4.8 2.5   0.2          
 252798.7   1.1    0.2          
 352795.8   2.5 1.5   0.2          
 4527   62.7 0.4           36.9  
 552799.2   0.2 0.2   0.4          
 6527   100.0              
2a1527 98.9 0.2   0.4   0.2 0.2  0.2      
 252760.3 0.6 0.8 0.8 36.3   0.6       0.2 0.6  
 3527 40.3 3.6 0.8  50.6  0.2 0.2     0.2  4.2  
 4527 58.9   0.2 39.2 0.2  0.4   0.8 0.4     
 552739.2 0.2  0.4 0.4 0.2 1.9 56.7   0.2 0.2  0.2 0.6   
 652742.4   7.6 49.6  0.2 0.2          
 75270.2 96.6    2.5    0.4    0.4    
 852733.7 9.9 10.1 0.6 2.7 4.2  2.7 0.2  0.2    11.6 24.3  
 95279.7 3.0 5.1 7.2 30.8 2.7 0.2  0.4 0.2   36.1 2.9  1.5  
2b15275.9 40.5 5.1 2.1 3.6 3.6 0.4  0.8 0.6 0.4 33.8 0.6 0.4 0.4 1.1  
 252738.0 1.0 4.9 9.5 40.5 2.3  0.6    1.1 0.8  0.4 1.0  
 35270.6 16.5 54.4 1.0 0.6 24.5    0.2  0.2  0.4  1.7  
 45271.1 41.1 3.4  0.6 52.1   0.6 0.2  0.2    0.6  
 552787.5 0.6 0.6 0.2 8.6 0.4 0.2 1.5  0.2    0.2    
 652795.1   2.5 2.5             
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2c1527 81.6 2.7 0.2  0.6  0.2 13.9   0.4    0.6  
 2527 0.2 36.5 1.1  0.2 0.4    0.4    1.7 59.3  
 35270.2 9.3 53.8 0.4 1.7 12.5  2.3 1.0   0.4 1.1 0.8 0.2 16.2  
2d15272.7 66.0 0.6 1.9 20.5 2.3  0.4 1.7 0.4 1.7 0.8 0.2 0.2 0.2 0.6  
 2527 95.6 0.2 0.4 1.3 1.0    0.2  0.6   0.4   
 352796.4 0.2 0.2 0.6 0.8      0.6 0.2   0.4 0.8  
 45270.6 1.1    97.0        0.4 0.4 0.2  
 55274.6    95.4             
2e15270.2 69.8 8.0  0.6 19.6 0.4  0.2 0.2     0.2 1.0  
 252792.6   1.1 5.9 0.4            
 352747.0 0.4 0.6 8.6 33.5 0.2  0.2     7.0  0.6 1.7  
 45273.8 32.7 5.7 21.3 20.7 5.1  2.3  0.4  1.3  0.2  5.9  
 55279.3 50.4 3.4 3.6 0.8 28.1   0.6  0.4 0.2    2.5  
2f152796.6  0.2  2.3 0.4        0.2    
 2527 97.5 0.2 0.2  1.5    0.4        
 3527100.0                 
 4527 1.3 98.7               
 552791.4 0.2 0.8 1.3 2.1 3.6  0.2  0.2    0.2    
 65271.0 62.0 2.5 10.1 8.4 11.2 0.4   0.4  0.6    3.4  
2g152765.2 3.4 2.1 2.1 21.1 1.0  0.2   0.8  1.0 0.2 1.3 1.7  
 252723.8 2.7 7.8 40.9 13.1 4.6 0.2  0.2  0.2  1.3 0.4 0.6 4.2  
 352764.6 4.8 11.6 2.7 12.7 1.3    0.2 0.2     1.5  
 452724.5 1.7 0.2 19.4 52.7 0.2    0.2 0.2   0.2 0.4 0.4  
 552738.8 46.4 1.7 1.1  11.0  0.2    0.2     0.6