28S-D2_helix-3-1
Stems - interleave 3, 28S-D2_helix-3-1
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3161 93.3               3.3 
 26191.7                3.3 
 361  91.7   1.7           3.3 
 461 90.0        1.7       3.3 
 56195.0                3.3 
 661 95.0               3.3 
3a161 96.7               3.3 
 261 96.7               3.3 
 36196.7                3.3 
 461 13.3 5.0   78.3           3.3 
 561 5.0    91.7           3.3 
 66195.0 1.7               3.3 
3b16155.0   6.7 31.7   3.3         3.3 
 26195.0               1.7 3.3 
 361 10.0    85.0   1.7        3.3 
 46195.0              1.7  3.3 
3c161 8.3    86.7   1.7        3.3 
 261 95.0    1.7           3.3 
 36196.7                3.3 
 46193.3    3.3            3.3 
 561  46.7   46.7    3.3       3.3 
 661 96.7               3.3 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3d16195.0    1.7            3.3 
 26191.7    3.3         1.7   3.3 
 361 58.3    6.7    18.3  13.3     3.3 
3e1611.7 71.7 3.3 5.0  15.0           3.3 
 2611.7 85.0 3.3   5.0          1.7 3.3 
 36195.0    1.7            3.3 
 46171.7   21.7 3.3            3.3 
 56166.7   11.7    1.7       16.7  3.3 
3f-1161 95.0    1.7           3.3 
 261 1.7 93.3              3.3 
 36193.3    3.3            3.3 
 461  1.7   78.3         3.3 13.3 3.3 
 561 85.0 6.7   3.3     1.7      3.3 
 6613.3 83.3  5.0     1.7   1.7    1.7 3.3 
 761 95.0   1.7            3.3 
 86190.0 1.7   3.3            5.0 
3f-2161 90.0 3.3   1.7           5.0 
 26193.3    1.7            5.0 
 361 83.3    11.7           5.0 
 4613.3 20.0    6.7           66.7 
 561 3.3    1.7           93.3 
 661     1.7           98.3