16S
Stems - interleave 7, 16S
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
66161    20.0 1.7          63.3 10.0 
 261 68.3 15.0 1.7             11.7 
 361 11.7 36.7   36.7           15.0 
 461  85.0              15.0 
 561 3.3 76.7 3.3  1.7           15.0 
 661 6.7 16.7 30.0 1.7       1.7    28.3 15.0 
 761  8.3 38.3  3.3  1.7 1.7   1.7 3.3   26.7 15.0 
 861    85.0            15.0 
671615.0   45.0 41.7            3.3 
 261   55.0 33.3           1.7 3.3 
 361 3.3 88.3              3.3 
 461 96.7               3.3 
6816196.7                3.3 
 261 96.7               3.3 
 361 5.0 61.7   28.3          1.7 3.3 
 4613.3   83.3 8.3           1.7 3.3 
 561  95.0          1.7    3.3 
 661   1.7 93.3        1.7    3.3 
 761   96.7             3.3 
 8613.3 3.3 28.3 20.0  1.7 1.7         8.3 33.3 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
69161 3.3 88.3   5.0           3.3 
 2611.7    95.0            3.3 
 361           1.7     3.3 
 4611.7   83.3 11.7            3.3 
 56195.0   1.7             3.3 
 6611.7  51.7    36.7      6.7    3.3 
70161 95.0       1.7        3.3 
t1161   85.0 5.0   1.7 1.7   1.7    1.7 3.3 
7116196.7                3.3 
 261 11.7 75.0 1.7  3.3          5.0 3.3 
 361  90.0   1.7          5.0 3.3 
 461 6.7 65.0 3.3  21.7           3.3 
 5613.3  5.0 80.0 1.7 5.0          1.7 3.3 
 661  3.3   93.3           3.3