16S
Stems - interleave 9, 16S
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
74161 96.7               3.3 
 261 95.0          1.7     3.3 
 361 16.7 80.0              3.3 
 4616.7   85.0 5.0            3.3 
 561   96.7             3.3 
 66191.7   3.3 1.7            3.3 
 761   96.7             3.3 
 861 3.3 83.3 5.0  1.7          3.3 3.3 
 961 10.0 85.0   1.7           3.3 
 1061  96.7              3.3 
 1161  90.0   3.3          3.3 3.3 
75161   90.0   5.0  1.7        3.3 
 261 5.0 90.0   1.7           3.3 
 361  8.3 83.3 1.7  1.7         1.7 3.3 
 461 3.3 48.3 38.3 3.3 1.7  1.7         3.3 
 5611.7 1.7 50.0 35.0  3.3 1.7       1.7  1.7 3.3 
 6611.7 1.7 61.7 20.0 1.7 5.0 3.3  1.7        3.3 
 761 3.3 36.7 35.0 8.3  5.0  3.3    1.7 1.7 1.7  3.3 
 861 1.7 23.3 33.3 8.3 13.3  1.7 5.0    1.7 1.7  6.7 3.3 
801613.3 1.7 45.0 35.0 5.0 1.7       5.0    3.3 
 26110.0   61.7 23.3   1.7         3.3 
 3616.7 1.7 8.3 71.7 6.7        1.7    3.3 
 4611.7  75.0   11.7 1.7        1.7 5.0 3.3 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
811611.7  36.7 45.0 6.7           6.7 3.3 
 261 5.0 43.3 35.0 5.0 3.3 1.7      1.7   1.7 3.3 
 3611.7  13.3 75.0 5.0           1.7 3.3 
 461   90.0        5.0    1.7 3.3 
 561   96.7             3.3 
 661   96.7             3.3