28S-D2
Stems - interleave 4, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3j160100.0                 
 260  100.0               
 360 39.0 61.0               
 460 88.1 8.5    1.7         1.7  
3k-1160   86.4 13.6             
 260 10.2 71.2 1.7  5.1 5.1     1.7 3.4   1.7  
 360 91.5 1.7   3.4      3.4      
 460 93.2 3.4   3.4            
 56088.1   6.8 5.1             
 660  98.3   1.7            
3k-2160 96.6 1.7   1.7            
 260   11.9 88.1             
3l160   100.0              
 26098.3    1.7             
 360 98.3 1.7               
3m160100.0                 
 26022.0  1.7 8.5 67.8             
 360 16.9 79.7   1.7    1.7        
 460 67.8 15.3   16.9            
 560   100.0              
 66020.3   79.7              
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3n160 3.4 67.8   27.1          1.7  
 26011.9   32.2 55.9             
 36071.2   25.4 3.4             
 460 13.6 3.4   83.1            
3o160   88.1 6.8  1.7  1.7         
 260 98.3    1.7            
 360100.0                 
 46098.3    1.7             
3p160   98.3    1.7          
 260 98.3 1.7