28S_D2
Stems - interleave 0, 28S_D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
1a1117 81.0                
 2117 80.2                
 3117  81.0               
 411792.2                 
 5117   92.2              
 6117    92.2             
 7117   92.2              
1b1117 87.1 6.0               
 2117 93.1                
 3117 90.5    2.6            
 4117   92.2 0.9             
 5117   92.2     0.9         
 6117   92.2        0.9      
2111787.1   5.2 4.3             
 211789.7   6.0  0.9            
 311794.8    1.7             
 4117   96.6              
 511794.8    0.9          0.9   
 6117   96.6              
2a1117 97.4                
 211695.7    1.7   0.9          
 3116 4.3 6.1 1.7  77.4          8.7  
 4116 90.4    3.5   1.7         
 511611.3   0.9 0.9 0.9 0.9 79.1 1.7    0.9  1.7   
 6116   0.9             96.5 
 711614.8   30.4 53.0             
 8116 87.0    10.4            
 911693.9 0.9   1.7             
 101167.8   30.4 50.4 0.9 0.9 0.9  0.9   2.6   1.7  
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2b11163.5 57.4 7.8 5.2 6.1 8.7   1.7 3.5  0.9 2.6   0.9  
 211667.8 5.2 7.0 6.1 7.0 3.5  0.9        0.9  
 31160.9 18.3 16.5 3.5 1.7 53.9  0.9        2.6  
 4116 30.4 5.2   60.0       0.9 0.9 0.9   
 511686.1 0.9 0.9  9.6        0.9     
 611694.8   0.9 1.7             
 7116 97.4 0.9               
 8116  0.9   0.9         3.5 93.0  
 9116 0.9 93.9             3.5  
2c11162.6 68.7 3.5 5.2 7.0 2.6   6.1       2.6  
 2116   0.9             94.8 
 3116 94.8            0.9    
 411692.2 0.9 0.9 2.6       0.9     0.9 0.9 
 5116 2.6   0.9 93.9        0.9    
2d111693.0    5.2        0.9     
 2116 71.3 7.8   20.0            
 311690.4    8.7             
 411639.1   9.6 46.1 0.9          1.7 1.7 
 51161.7 49.6 1.7 10.4 1.7 9.6    0.9  13.0    10.4  
 611617.4 12.2  7.8 0.9 52.2         3.5 5.2  
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2e111693.0    6.1             
 2116 83.5 0.9   11.3    1.7 0.9       
 311698.3    0.9             
 4116  99.1               
 511687.0   0.9 10.4         0.9    
 61160.9 36.5 15.7 3.5 1.7 32.2   0.9 2.6  0.9  0.9  1.7  
 71162.6 40.9 0.9 0.9  47.8  0.9 1.7 0.9 0.9   0.9 0.9