28S_D2
Stems - interleave 1, 28S_D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
31117 97.4        0.9        
 211795.7    2.6             
 3117  98.3               
 4117 98.3                
 511796.6          0.9   0.9    
 6117 97.4    0.9            
3a1117 99.1    0.9            
 2117 100.0                
 3117100.0                 
 4117 0.9 13.8   83.6    0.9   0.9     
 5117  0.9   98.3     0.9       
 611799.1   0.9              
3b111765.5   6.0 28.4             
 211795.7   0.9 1.7          0.9   
 3117 27.6    71.6            
 41170.9   2.6 94.8           1.7  
3c1117 40.5 41.4   11.2    3.4   0.9   1.7  
 2117 91.4 1.7 0.9  6.0            
 311798.3    1.7             
 411794.0   0.9 5.2             
 5117 81.9 12.9 2.6  0.9    0.9        
 6117 84.5 1.7   12.1   0.9         
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3d111792.2  1.7  3.4 0.9  0.9          
 211792.2   2.6 4.3   0.9          
 3117 82.8 2.6 2.6 2.6 0.9    5.2  2.6      
3e11172.6 63.8 10.3 2.6  0.9 5.2 0.9    0.9 6.0 0.9 0.9 4.3  
 21170.9 89.7 1.7 0.9  2.6 0.9  0.9         
 311782.8 5.2  2.6 6.9          0.9 0.9  
 411725.9 0.9 1.7 32.8 15.5 0.9 0.9      0.9   19.0  
 511710.3 1.7 34.5 16.4  5.2 4.3 7.8  0.9      18.1  
3f-1111792.2   1.7  0.9     1.7 1.7 0.9 0.9    
 211796.6   0.9    0.9   0.9       
 3117  89.7   1.7 0.9   7.8        
 41170.9 95.7 0.9        2.6       
 5117 1.7 95.7       0.9        
3f-2111799.1    0.9             
 2117  20.7 2.6 6.0 62.1  0.9  0.9  1.7   0.9 4.3  
 31170.9 80.2 1.7 2.6 0.9 9.5    3.4        
 411784.5 1.7  2.6 7.8        0.9  0.9 0.9  
 51170.9 81.0 2.6 0.9 2.6 7.8   1.7 0.9  0.9      
 611791.4   0.9 7.8