28S_D3
Stems - interleave 5, 28S_D3
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
D3-119390.2    7.6   1.1      1.1    
 29364.1  1.1 29.3 2.2  1.1      1.1   1.1  
 3931.1 19.6 30.4 3.3  45.7            
 493  1.1              26.1 
 5933.3 76.1 9.8 4.3  3.3    1.1      1.1  
 69392.4  1.1  1.1 3.3            
 79375.0 7.6 2.2 4.3 5.4 1.1          2.2  
 89312.0 31.5 30.4 4.3  20.7    1.1        
D3-219395.7    1.1             
 29397.8                 
 39397.8                 
 493   97.8              
 59394.6   2.2    1.1          
 693     96.7   1.1         
 79363.0    32.6             
 89165.6  7.8 3.3 13.3           8.9  
 9911.1 87.8 4.4   3.3    2.2        
 10913.3 21.1 71.1   2.2 1.1 1.1          
 1191 97.8 1.1   1.1            
 129195.6 1.1 1.1  1.1             
 13911.1 93.3    3.3    1.1  1.1      
 14911.1 1.1 1.1 3.3 87.8 1.1     1.1 3.3      
 1591 3.3 94.4 1.1 1.1             
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
D3-319178.9                 
 29181.1                 
 38985.2                 
 488 86.2                
 58786.0   1.2              
 687     86.0            
 787 87.2    1.2    1.2        
 887  89.5               
 987 88.4       1.2         
 1085 11.9 51.2   6.0   1.2 3.6  1.2   1.2 16.7  
 118494.0                 
 1284 94.0 1.2               
 1383  96.3               
 1483 95.1