28S-D2
Stems - interleave 5, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3j16196.7                3.3 
 261  96.7              3.3 
 361 95.0        1.7       3.3 
 461 26.7  10.0 1.7   1.7  1.7 5.0     50.0 3.3 
3k16178.3    13.3   5.0         3.3 
 2615.0    86.7         1.7   3.3 
 361 96.7               3.3 
 461 76.7 18.3   1.7           3.3 
 561 95.0          1.7     3.3 
 66193.3   1.7 1.7            3.3 
 761 78.3 16.7       1.7       3.3 
 861 95.0    1.7           3.3 
 96173.3    15.0        6.7    3.3 
3l161   96.7             3.3 
 26185.0    11.7            3.3 
 361 96.7               3.3 
3m16186.7    8.3 1.7           3.3 
 26193.3   1.7             3.3 
 361 6.7 23.3 1.7  63.3          1.7 3.3 
 461 96.7               3.3 
 5611.7   93.3             3.3 
 66193.3            3.3    3.3 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3n161 78.3       5.0 1.7  10.0  1.7   3.3 
 261 90.0 1.7   1.7   1.7 1.7       3.3 
 361 83.3 1.7   10.0      1.7     3.3 
 46196.7                3.3 
 56190.0 1.7             5.0  3.3 
3o161   66.7 18.3           11.7 3.3 
 261 96.7               3.3 
 36196.7                3.3 
 46196.7                3.3 
3p161   53.3   1.7 41.7         3.3 
 261 90.0        6.7       3.3 
 3611.7    16.7            81.7