28S-D2
Stems - interleave 1, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
1a157 55.4        1.8        
 257 55.4        1.8        
 357  57.1               
 45758.9       1.8          
 558   61.4              
 658    68.4             
 758   70.2              
1b158 84.2                
 258 66.7                
 358 86.0                
 458   86.0              
 558   86.0              
 658   86.0   1.8           
216098.3    1.7             
 26098.3       1.7          
 36098.3    1.7             
 460   100.0              
 560100.0                 
 660   100.0              
2a160 100.0                
 260100.0                 
 360     100.0            
 460 100.0                
 560       100.0          
 660    100.0             
 760 100.0                
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2b160 98.3        1.7        
 260   100.0              
 360 1.7 84.7   10.2          3.4  
 460  13.6   79.7          6.8  
 560  93.2   3.4          3.4  
 660  98.3  1.7             
 76094.9   5.1              
 860     100.0            
 960   94.9   3.4 1.7          
2c1603.4   86.4 10.2             
 260  98.3   1.7            
 360   88.1 11.9             
 460 13.6 10.2   66.1    3.4     1.7 5.1  
 5601.7  5.1 52.5 32.2           6.8  
 660   96.6 1.7           1.7  
 76096.6  1.7               
2d1601.7   86.4 11.9             
 260 8.5 86.4   5.1            
 360100.0                 
 460   84.7    15.3          
 560  18.6   78.0         1.7   
 660   76.3 23.7             
 76078.0   5.1 16.9             
 86096.6   1.7 1.7             
 960  3.4   96.6            
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
2e160  96.6            1.7 1.7  
 260   100.0              
 360 100.0                
 460  100.0               
 560   91.5        1.7     3.4