28S-D2
Stems - interleave 2, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3160 94.9                
 2603.4   6.8 84.7             
 360  96.6               
 460 96.6                
 56094.9                 
 660 93.2    1.7    1.7        
3a160 100.0                
 260 98.3 1.7               
 36098.3    1.7             
 460  5.1   86.4          8.5  
 560     100.0            
 66086.4   10.2 3.4             
3b1606.8   83.1 8.5   1.7          
 26091.5   1.7 5.1           1.7  
 360  72.9   22.0 1.7   3.4        
 46018.6    81.4             
3c160  18.6   81.4            
 260 86.4 3.4   8.5        1.7    
 36018.6   3.4 76.3      1.7       
 460100.0                 
 560 1.7 71.2   25.4       1.7     
 660 88.1 8.5   3.4            
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3d16098.3   1.7              
 26071.2   5.1 23.7             
 360    1.7     1.7  96.6      
3e160 96.6 1.7   1.7            
 260 93.2 5.1 1.7              
 3601.7   67.8 28.8           1.7  
 460   88.1 6.8   3.4        1.7  
 560100.0                 
 660                100.0 
3e216098.3  1.7               
 26091.5   8.5              
 360  84.7    3.4      11.9     
3f160 86.4 10.2       3.4        
 260  100.0               
 3601.7  94.9   3.4            
 460 1.7 69.5   27.1          1.7  
 5601.7   83.1 15.3             
 660   94.9 3.4           1.7  
 760  94.9 1.7  1.7          1.7  
 86011.9  66.1 16.9 5.1             
 960 5.1 44.1 11.9  5.1    3.4  11.9   1.7 3.4 11.9