28S-D2
Stems - interleave 4, 28S-D2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3j18598.8       1.2          
 285 2.4 97.6               
 385 70.2 16.7 3.6  8.3    1.2        
 4858.3 46.4 3.6 10.7 9.5 2.4  2.4 6.0    1.2 4.8  4.8  
3k18565.5   4.8 19.0  1.2 7.1    1.2 1.2     
 2857.1  2.4 16.7 67.9   1.2     1.2 1.2  2.4  
 385 95.2 1.2 2.4  1.2            
 4851.2 69.0 22.6 1.2  1.2 1.2  1.2   1.2      
 585 92.9 6.0               
 68592.9 1.2 1.2 2.4 1.2   1.2          
 785 38.1 52.4 1.2  7.1          1.2  
 8851.2 85.7 4.8   7.1      1.2      
 98548.8   3.6 44.0 1.2       2.4     
3l1857.1  1.2 84.5 4.8   2.4          
 28598.8    1.2             
 3851.2 86.9 3.6   2.4    3.6 1.2 1.2      
3m18573.8 4.8  2.4 11.9 2.4   1.2 1.2   2.4     
 28564.3 4.8 3.6 19.0 4.8 2.4            
 385 50.0 17.9 1.2  27.4    1.2   1.2   1.2  
 4851.2 79.8 4.8 2.4  2.4     2.4   1.2  6.0  
 5856.0  3.6 81.0  1.2      6.0   1.2 1.2  
 68576.2 4.8 6.0 3.6  3.6    1.2     2.4 2.4  
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3n185 75.0 6.0 6.0  10.7    2.4        
 285 59.5 23.8 3.6  13.1            
 3851.2 86.9 2.4 1.2 2.4 6.0            
 48583.3   4.8 10.7  1.2           
 58577.4 2.4  10.7 9.5             
3o1851.2  2.4 52.4 29.8  1.2 1.2  1.2      10.7  
 285 98.8  1.2              
 385100.0                 
 48594.0   4.8        1.2      
3p185 1.2 1.2 53.6 1.2  7.1 34.5     1.2     
 285 85.7 4.8 1.2  1.2 3.6          3.6 
 385    3.6            96.4