18S_Domain_1+V1
Stems - interleave 0, 18S_Domain_1+V1
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H91176 34.3               58.3 
 2176  34.3              58.3 
 317634.9                58.9 
 417635.4       0.6         58.9 
 5176  0.6   36.6           58.9 
H171176  40.0              2.9 
 2176 40.0               2.9 
 3176 36.0        4.0       2.9 
H2711760.6   50.3    1.1         0.6 
 21761.7   1.7 49.7            0.6 
 3176  54.3   2.3    2.3       0.6 
 4176   59.4             0.6 
 5176  59.4              0.6 
 6176   59.4             0.6 
 7176 2.3 2.9 0.6  53.7           0.6 
 817658.3    1.7            0.6 
 9176 60.0               0.6 
 10176  57.1   3.4    0.6       0.6 
H3911762.9      0.6      58.3 0.6   4.0 
 2176  58.9   2.9         0.6  4.0 
 3176 3.4 1.7       54.9 0.6 1.7     4.0 
 4176  61.7       0.6       4.0 
 5176 59.4    0.6    2.9       4.0 
 61760.6       65.7         4.0 
 7176    0.6    66.3        4.0 
 8176   62.9 3.4           0.6 4.0 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H47117666.9             0.6   4.0 
 217671.4                4.0 
 3176 72.0               4.0 
 4176 72.0               4.0 
 5176  80.0              4.0 
 617680.0                4.0 
 7176 80.0               4.0 
H61117678.9   0.6         0.6    16.6 
 2176 1.1    78.9           16.6 
 317680.0 0.6   0.6            16.6 
 4176  80.0              16.6 
 51760.6                99.4 
 6176 0.6               99.4 
 7176  0.6              99.4 
 817612.0  0.6 9.1 53.1   5.7         17.7 
 91761.1 79.4               18.3 
 10176 63.4 10.3 0.6  0.6 1.1   0.6   4.6    18.9 
H1131176 88.0        1.7       9.7 
 2176  89.7              9.7 
 3176 89.7               9.7 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H1221176  8.6     4.0  2.3 1.7    73.1  9.7 
 2176 89.7               9.7 
 31761.1   84.6 4.0            9.7 
 417688.6 0.6  0.6             9.7 
 5176   1.1        6.9   1.1 80.6 9.7 
 6176 10.3 0.6   78.3        0.6   9.7 
 7176 0.6  74.9 4.6   0.6   3.4   0.6  5.1 9.7 
 81760.6  89.1              9.7 
 91760.6  80.6   7.4 0.6         0.6 9.7 
 1017612.0   58.3 16.6    0.6   0.6    1.7 9.7 
 1117688.6       0.6     0.6    9.7 
 121760.6 1.1  86.3 0.6           0.6 9.7 
 131760.6 1.7 74.9   8.6    3.4  0.6     9.7 
 1417617.7 4.0 0.6 5.1   0.6 1.7  1.1 34.3 21.7 2.3   1.1 9.7 
 151761.1 5.1 0.6 1.1 1.1 17.1 3.4 0.6 5.1    3.4 50.3  1.1 9.7