18S_Domain_3_V9
Stems - interleave 26, 18S_Domain_3_V9
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H13991176 44.6               10.9 
 217645.1                10.9 
 3176         45.7       10.9 
 4176 61.7               10.9 
 517661.7                10.9 
 6176 60.0    0.6    1.7       11.4 
 7176         61.7  2.9     11.4 
 8176  65.1              11.4 
 9176   65.1             11.4 
 101760.6 64.6               11.4 
 11176  61.7      2.9        11.4 
 12176 65.1        0.6       11.4 
 13176     65.1         0.6 0.6 11.4 
 14176  60.6       10.9   0.6    11.4 
 151764.6    70.3            11.4 
 16176   74.9 0.6            11.4 
 171767.4   65.1    2.3        0.6 11.4 
 18176 9.1 61.7   1.7         2.3 0.6 11.4 
 1917656.6   0.6 13.1         2.9  1.7 11.4 
 201760.6 0.6 0.6 68.6 1.1 0.6  3.4         12.0 
 21176  73.7  0.6          1.1  12.0 
 22176 2.9    69.7        1.7  0.6 12.0 
 23176   74.9 0.6            12.6 
 2417673.7  0.6  0.6   0.6         12.6 
 25176 2.9 72.0       0.6       12.6 
 2617675.4                12.6 
 2717666.9   1.7 6.3   0.6         12.6 
 28176 16.6 41.1 1.7  0.6  4.0  1.7  2.3   6.3  12.6 
 29176 68.6 0.6 0.6  5.1    0.6       12.6 
 301760.6   1.1        0.6   2.9 69.7 12.6 
 31176  68.6   0.6      1.1    5.7 12.6 
 32176 69.7    4.6    0.6  0.6   0.6  12.6 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H15061176     20.0           56.6 
 2176  19.4   0.6           57.1 
 3176  20.0             0.6 57.7 
 4176 20.6        0.6       57.7 
 5176 10.9        10.3       58.3 
 617620.6          0.6  0.6    64.6 
 7176     21.1         0.6  65.7 
 8176   21.1     0.6        66.9 
 917621.1    0.6            68.0 
 1017620.6            0.6  1.1  68.0