28S-D2_helix-3-1
Stems - interleave 2, 28S-D2_helix-3-1
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3185 96.4          2.4      
 28590.5   1.2 7.1             
 385  92.9   1.2         1.2 3.6  
 485 92.9 1.2   4.8            
 58595.2 1.2  1.2 1.2             
 685 98.8                
3a185 100.0                
 285 97.6 2.4               
 38597.6   1.2 1.2             
 485 17.9 11.9   67.9    1.2     1.2   
 585 14.3    85.7            
 68595.2   2.4 2.4             
3b18545.2  1.2 14.3 36.9   1.2        1.2  
 28591.7  2.4 4.8              
 385 8.3    91.7            
 48597.6 1.2      1.2          
3c185 10.7 34.5   54.8            
 285 85.7 9.5   2.4    1.2      1.2  
 38592.9  2.4 1.2 2.4           1.2  
 48584.5   6.0 6.0   1.2        2.4  
 585 25.0 40.5 4.8  26.2    2.4  1.2      
 685 85.7 1.2   13.1            
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
3d18591.7  1.2  7.1             
 28583.3   4.8 11.9             
 3858.3 58.3 8.3 2.4 3.6 6.0    6.0  4.8 1.2  1.2   
3e1851.2 77.4 2.4 9.5  4.8    3.6      1.2  
 2851.2 78.6 1.2 1.2  16.7     1.2       
 38566.7 6.0  10.7 11.9 1.2  1.2  1.2 1.2       
 48561.9 2.4  20.2 4.8 6.0 1.2      1.2   2.4  
 58565.5 2.4 10.7 11.9 2.4 2.4         2.4 2.4  
3f-1185 94.0        6.0        
 285 4.8 94.0            1.2   
 38577.4  7.1 9.5 2.4 1.2        2.4    
 4854.8 7.1 13.1 1.2  58.3    1.2 1.2 1.2   1.2 9.5  
 5853.6 56.0 6.0 8.3 7.1 10.7  1.2 1.2       4.8  
 68526.2 31.0 6.0 10.7 4.8 7.1 1.2 1.2 3.6    2.4 1.2 2.4 1.2  
 7853.6 66.7 9.5 3.6 1.2 3.6 1.2  1.2 3.6      1.2  
 88566.7 13.1 4.8 4.8 3.6     1.2 3.6    1.2 1.2