18S_Domain_1+V2
Stems - interleave 2, 18S_Domain_1+V2
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H184b-11176 0.6 89.7              9.7 
 2176 0.6 89.1   0.6           9.7 
 3176 0.6  86.3    0.6 2.9        9.7 
 41760.6  86.9   0.6         2.3  9.7 
 5176 0.6 69.1   19.4     0.6     0.6 9.7 
 61761.1   75.4 10.9 0.6  2.3         9.7 
 7176 77.1 1.7   4.0  0.6  6.3  0.6     9.7 
 8176 87.4       1.1 0.6    0.6  0.6 9.7 
 91761.1 0.6 1.1 79.4 4.6  1.7 0.6 0.6   0.6     9.7 
 101760.6 0.6 1.1 71.4 0.6  4.0 1.7 5.1     1.1  0.6 11.4 
H184b-21176 82.3 1.1 1.7 1.1 0.6 2.3        0.6  10.3 
 217676.0 3.4 4.0 1.1 1.7  0.6    0.6  1.1    10.3 
 317666.9 2.9 2.3 5.7 9.7   1.1         10.3 
 417613.7 9.1 11.4 12.0 3.4 15.4     0.6  0.6   19.4 12.0 
 517410.4 46.2 5.2 2.9 2.9 6.9 0.6  0.6 2.3 1.2 3.5   0.6 1.7 13.9 
 617436.4 11.0 3.5 4.6 5.2 7.5  0.6   1.2 0.6  0.6  0.6 28.3 
 717429.5 10.4 2.9 4.0 4.6 3.5    0.6 0.6    1.7  41.6