18S_Domain_1+V3
Stems - interleave 5, 18S_Domain_1+V3
HelixBasebase pair composition %
 pair# seqscomplementarynon-complementary
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H3391176 96.0               4.0 
 2176  1.1    94.3   0.6       4.0 
 3176  95.4       0.6       4.0 
 4176 96.0               4.0 
H3671176  96.0              4.0 
 2176   96.0             4.0 
 3176 96.0               4.0 
 4176 95.4       0.6        4.0 
 5176  7.4   88.0   0.6        4.0 
 61760.6 91.4 1.1 0.6  0.6           4.0 
 71760.6 92.0 2.9        0.6      4.0 
 8176 93.1 0.6   1.1           4.0 
 917678.3 1.1      15.4       1.1  4.0 
H4061176 5.1      0.6 90.3        4.0 
 2176 96.0               4.0 
 317679.4   12.6 3.4        0.6    4.0 
 41761.7 2.9  90.3 0.6    0.6        4.0 
 5176 2.9 85.7  1.7 4.6      0.6   0.6  4.0 
 61766.3 0.6  73.1 8.0   1.7  2.9  2.9   0.6  4.0 
 7176 93.1 1.1      1.7        4.0 
 817686.3 1.1 1.1 7.4             4.0 
 917682.9   4.6 4.6   1.1     2.3 0.6   4.0 
 1017676.0  0.6 13.1 5.7   0.6         4.0 
 11176 94.9   0.6      0.6      4.0 
 12176 4.0 90.3   1.1     0.6      4.0 
 13176 92.6       1.1        6.3 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H4411176   70.3   4.0 16.6 5.1        4.0 
 2176   40.0   1.1  54.9        4.0 
 3176  1.1   94.3          0.6 4.0 
 4176    0.6        95.4    4.0 
 5176     0.6 15.4  78.3     1.1   4.0 
 617692.6 0.6 0.6 1.7           0.6  4.0 
 7176 2.9 49.7 1.1 0.6 1.1 22.9 1.7  13.7   1.7  0.6  4.0 
H50011760.6 1.7 80.0 12.6 0.6            0.6 
 2176 1.1 89.7   4.0    0.6       0.6 
 317694.3   1.1             0.6 
 417693.1   2.3             0.6 
 5176   95.4             0.6 
 617694.3    0.6   0.6         0.6 
H505117693.7    2.3            0.6 
 217693.7    0.6   1.1         0.6 
 3176 94.3       1.1  0.6      0.6 
H511a1176 98.3               0.6 
 2176  98.3              0.6 
 317697.7              0.6  0.6 
 417698.3                0.6 
   gccguaauguugaaacagcacccugaggucuu--
H511b117698.3          0.6      0.6 
 2176 99.4               0.6